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功能蛋白组学实验中心
时间:
2014/05/28
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一、实验中心简介
Marc Wilkins 在1994年率先提出蛋白质组学(Proteome)这一概念,它是由蛋白质(Protein)与 基因组(Genome)两个单词的组合词,其本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞等过程的整体而全面的认识。而功能蛋白组学是指蛋白之间、蛋白质与DNA/RNA间相互作用的研究,以细胞内与某个功能有关的一群蛋白质为主要研究对象,建立细胞内外信号传递的复杂网络。代谢
功能蛋白组学(Functional Proteomics)的研究可以注重从局部入手, 以细胞内的蛋白质群体为主要研究对象, 重点放在那些可能涉及到特定功能机理的蛋白质群体上。其群体可大可小, 取决于要研究的功能特点和研究方法、手段和实验设计等。在研究蛋白质群体的基础上, 可不断地把许许多多不同的蛋白质群体统计组合, 从而描绘出接近于生命细胞的“全部蛋白质”的蛋白质组图谱。
功能蛋白组学实验中心成立于2011年,是一个走在国际前沿,极具竞争力的国际科学研究与开发(R&D)团队。本实验中心与北京大学、中国科学院生物物理所、美国卫生部国立卫生研究院(NIH)等国内外知名研究机构,在蛋白质质谱序列分析、高分辨动态显微成像和人才培养等方面建立实质性的,长期合作关系,已组建成为一个国际性的生物医学研究的合作平台,将基础生物医学研究与畜牧业生产中的重要疫病致病机理研究和防控开发相结合,占据该领域国际最前沿,并迅速将研究成果转变成新的生产技术和生产力,解决畜牧业生产中重要疫病防控的实际问题,开辟农业科技成果转化和产学研结合工作模式。
实验中心现有研究人员近30余名,其中杨毅教授于2013年被评为湖南省“百人计划”专家,2013年王爱兵教授被评为“神农学者”特聘教授。2011年以来,实验中心在各位科研人员的共同努力下已获得国家自然科学基金项目4项,省部级科研项目6项;发表SCI论文17篇;申请国家专利3项。产学研结合取得重要进展,获得企业合同科研经费210万元。2014年3月实验中心建立湖南农业大学首个SPF实验动物中心,培养无特殊病原体的小型实验动物(小鼠、大鼠和实验兔等)。
功能蛋白组学实验中心所有成员都坚定着“务实明理”的实验室文化,秉承着勇于攀登科研金字塔的理念陆续开展着实验课题,拓展后基因时代的每一处可利用领地,综合运用和了解新技术,行走在科研前沿,培养新型科技人才。
二、实验中心主要成员
1、杨毅:教授,功能蛋白组学实验中心负责人,湖南省“百人计划”专家,“神农学者”特聘教授,博士生导师,美国国立卫生研究院研究员。长期从事蛋白质大分子复合物结与功能等课题研究,尤其在大分子蛋白质的表达、纯化、组装及结构与功能模拟预测等方面研究。
2、王爱兵:教授,“神农学者”特聘教授,博士生导师,美国国立卫生研究院研究学者。主要致力于如何利用最新TALEN和CRISPR/Cas技术制作遗传修饰动物模型;以及利用植物(水稻或玉米)或其他系统(昆虫杆状病毒表达系统)生产动物疫苗。
3、邓治邦:教授,硕士生导师。针对胎儿期感染PCV2新生仔猪肠粘膜淋巴细胞凋亡的分子机制研究以及猪细小病毒PPV2010株对初产母猪繁殖障碍的影响及其机制研究。
4、王乃东:副教授,硕士生导师,美国乔治敦大学博士后。主要从事噬菌体抗体的制备和RNA干扰病毒侵入调控机理的研究。
5、刘伟:在职老师,博士。现主要针对研究日本血吸虫检测,并利用昆虫细胞表达系统研制诊断新方法,长期做寄生虫方向研究,总负责动物房的运作。
6、杨林:科研秘书。
三.实验室科研团队
功能蛋白组学实验室由PCV组、PRRSV组、检测组、高端显微成像组四个组交叉运作。
博士生导师:杨毅教授、王爱兵教授
硕士生导师:邓治邦教授,王乃东副教授,许道军师
博士生:呼高伟、蔡杰
研究生:湛洋、余婉婷、雷昕诺、张莉、张颜、龚茜、张思哲、毛玉、段宇红、朱哲、谢小红、胡意、刘思远。
科研团队
四、研究方向和内容
1.利用功能性蛋白质组学研究平台和全内反射荧光显微术在单分子水平和细胞内研究马达蛋白质分子与胚胎干细胞自我更新,及分化的分子机制;
2.开展病毒性动物疫病的疫苗及检测的基础与应用研究,包括病毒样颗粒(VLP)高端动物疫苗、实验动物模型建立及单分子病毒侵染机理研究、诱导型胚胎干细胞等国内急需的研究工作;
3. 针对对重要疫病病原的保护性抗原基因、免疫抑制基因、毒力基因和毒素基因等与宿主的免疫保护、病原的免疫逃脱以及致病力相关的基因进行克隆与表达,并研究这些蛋白的生物学功能以揭示病原微生物的致病机理。
五、科研成果
近期科研项目:
1、国家自然科学基金 (31270819,杨毅) , Myosin 7a马达蛋白质大分子复合物体外重建及功能研究, 2012.12-2016.12
2、湖南省自然科学杰出青年基金项目(S2013J5050,杨毅)马达蛋白质Myosin 7a-M7aBP-Rab复合物的功能研究,2013.12-2015.12
3、农业功能基因组学与分子育种人才培养与创新团队建设项目(杨毅), 2011.09-2013.06
4、猪蓝耳病病毒疫苗的研究与开发 (20114320120006,杨毅), 2012.12-2019.12
5、诱导型多功能干细胞研究 (杨毅); 美国国立卫生研究院(NIH), 2009.2-至今
6、国家自然科学基金(30901090,王乃东),应用鼠源性高亲和力噬菌体Fab 抗体筛选和克隆新的血清学H-Y 抗原基因,2010.01-2012.12
7、湖南省教育厅科学研究优秀青年项目(09B046,王乃东),利用高亲和力噬菌体抗体筛选血清学H-Y抗原,2010.01-2013.12
8、湖南省研究生创新基金项目(CX2009B154,王乃东), 利用噬菌体抗体筛选血清学h-y抗原, 2010.01-2013.12
9、国家自然科学基金 (31372406,邓治邦 王乃东), 胎儿期感染PCV2新生仔猪肠粘膜淋巴细胞凋亡的分子机制研究,2013.12-2017.12
10、分子马达功能与特性研究(王爱兵)2005-2013
11、转基因与基因敲除动物模型建立与利用(王爱兵)2013-2015
13、Large-scale sheep farm coccidia Inspection and technical regulations, Auspices of Hunan Province, local standards, (Wei Liu)2012-2013
14、The snail genetic variation in different endemic regions in Hunan Province”(Item Number:2011NK3072), the Department of Science and Technology, Hunan Province, (Wei Liu)2011-2012
15、Food chain of animal-borne parasites of livestock and poultry production safety”(Item Number:11245), the Bureau of Animal Husbandry and Fisheries, Hunan Province, (Wei Liu)2011-2013
近期发表论文:
1.Takagi Y, Farrow RE, Billington N, Nagy A, Batters C, Yang Y, Sellers JR, Molloy JE. Myosin-10 produces its power-stroke in two phases and moves processively along a single actin filament under low load. The Proceedings of National Academy of Sciences, USA. 2014, Apr 21.
2. Yang Y, Baboolal TG, Siththanandan V. A FERM domain autoregulates Drosophila myosin 7a activity. The Proceedings of National Academy of Sciences, USA, 2009, 106(11):4189-94
3.Guzik-Lendrum S。, Heissler SM, Billington N, Takagi Y, Yang Y, Knight PJ, Homsher E, Sellers JR. Mammalian myosin-18A, a highly divergent myosin. J Biol Chem. 2013 Mar 29;288(13):9532-48. doi: 10.1074/jbc.M112.441238. Epub 2013 Feb 4
4. Zhu LH, Wang AB*( Co-first author), Luo PC, Wang XA, Jiang DS, Deng W, Zhang XF, Wang T, Liu Y, Gao L, Zhang SM, Zhang XD, Zhang J, Li HL. 2014. Spondin 2 Inhibits Hepatic Steatosis, Insulin Resistance and Obesity via Interaction with Peroxisome Proliferator-Activated Receptor α in Mice. Journal of Hepatology. 60(5):1046-1054.
5.Billington N, Wang AB*(Co-first author), Mao J, Adelstein R S and Sellers JR. 2013. Expression and Characterization of Full-length Nonmuscle Myosin II Isoforms. Journal of Biological Chemistry. 288(46):33398-410.
6.Nagy A, Takagi Y, Billington N, Sun SA, Hong DK, Homsher E, Wang AB, Sellers JR. 2013. Kinetic Characterization of Nonmuscle Myosin IIB at the Single Molecule Level. Journal of Biological Chemistry. 288(1):709-22.
7. Ma XF, Kovács M, Conti MA, Wang AB, Zhang YF, Sellers J, Adelstein RS. 2012. Vertebrate Cell Cytokinesis Requires Nonmuscle Myosin II to Exert Tension but not to Translocate Actin. The Proceedings of the National Academy of Sciences. 109(12):4509-14.
8. Kim JH, Wang AB, Conti MA and Adelstein RS. 2012. Nonmuscle Myosin II is Required for the Internalization of the Epidermal Growth Factor Receptor. Journal of Biological Chemistry. 287(33):27345-58.
9. Zhang YF, Conti MA, Malide D, Dong F, Wang AB, Shmist Y, Liu C, Zerfas P, Daniels MP, Chan CC, Kozin E, Kachar B, Kelley MJ, Kopp JB, Adelstein RS. 2012. Mouse models of MYH9-related disease: Mutations in nonmuscle myosin II-A. Blood, 119(1):238-50.
10. Wang AB, Ma X, Conti MA and Adelstein RS. 2011. Distinct and Redundant Roles of the Nonmuscle Myosin II Isoforms and Functional Domains. Biochemical Society Transactions. 39(5):1131-5.
11. Deng ZHIBANG, Gong QIANLONG, Wang Naidong, Yuan ANWEN, Yu XING LONG, Vertical transmission of Porcine circovirus 2b (PCV2b) to mouse fetuses in maternal uterus by artificial insemination with semen from PCV2b-infected male mouse, Turk. J. Vet. Anim. Sci. 2013; 37: 475-478.
12.Naidong Wang, Anwen Yuan, Zhibang Deng, Qing Yang, Jun Ma, Qinghui Tan,Sizhe Zhang,Engineering the Male-specificity of Fab against SDM antigen by Chain Shuffling,Theriogenology,2013,79(8):1162-1170., Liqun Xue*, Shuliang Cui*
13. Zhi-Bang Deng, Nai-Dong Wang, Dao-Jun Xu, An-Wen Yuan , Meng Ge , Wei Luo, Li-Qun Xue, Xing-Long Yu. Viral distribution and lesions in Kunming mice experimentally infected with porcine circovirus type 2b,Vet Res Commun ,2011,35:181-192.
14. Deng ZB, Yuan AW, Luo W, Wang ND, Gong QL, Yu XL, Xue LQ, Transmission of porcine circovirus type 2b (PCV2b) in Kunming mice. Acta Vet Hung. 2013 Jun;61(2):234-43.
15. Zhi Bang Deng, An Wen Yuan, Wei Luo, et al. Transmission of porcine circovirus type 2B (PCV2B) in Kunming mice. Acta Veterinaria Hungarica, 2013(DOI: 10.1556/AVet.2013.004).
16. W. Liu, G. H. Liu, F.Li, Y. Liu et al.Sequence variability in three mitochondrial DNA regions of Spirometra erinaceieuropaei spargana of human and animal health significance. Journal of Helminthology.2011,1-5.
17. R.S.Dai, G. H. Liu, W. Liu et al.Sequence variability in two mitochondrial DNA regions and internal transcribed spacer among three cestodes infecting animals and humans from China. Journal of Helminthology.2011,1-7.
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